A funguje ti vůbec bootování z USB? Vyzkoušej si nejdříve pomocí té utility vytvořit bootovací disk (Create a DOS stratup disk) a pokud ti půjde bez problémů z něho nabotovat, pak má smysl se tím zabývat dále. Předpokládám, že máš vše ošetřeno i v biosu. Nakonec už se opakuji, psal jsem to už kdysi i zde jako tip http://www.craftcom.net/index.php?article=150
jak spolehlivě odzkoušet podporu HW na boot z USB média.
* Používej pouze format na FAT16 ten je jistota.