furt jenom píšeš že něco nejde, bez detailů zda je nějaká chybová hláška nebo vůbec nic.

odviroval jsi? odspywaroval jsi? spustí se ty programy vůbec?

soubor C:\WINDOWS\regedit.exe přejmenuj na regedit.com a zkus ho spustit. (pokud máš nastaveno skrývání přípon, je to tvůj problém)
v tom editoru registrů zkontroluj obsah větví:

[HKEY_CLASSES_ROOT\.exe]
@="exefile"
"Content Type"="application/x-msdownload"

[HKEY_CLASSES_ROOT\exefile]
@="Application"

[HKEY_CLASSES_ROOT\exefile\shell\open]
"EditFlags"=hex:00,00,00,00

[HKEY_CLASSES_ROOT\exefile\shell\open\command]
@="%1" %*