přeinstaluj to stejnou verzí windows.
scandisk měl najít nebo označit vadné místo, tak vadný soubor oprav přeinstalací se stejným servicepackem - moc času to nezabere.

v registrech sice nejspíš stále zůstává záznam o neuskutečněném chkntfs, ale to by se po 1-2 restartech mělo spravit.
až nějaká windows naběhnou, jde to zakázat: chktnfs /x