nevadí to - auto znamená, že si nastavení vynutí až operační systém.
pevné nastavení v biosu použiju jen v tom případě, kdy windows zatvrzele nastavuje pio mód, toto je umravní. u tebe je zdánlivě vše ok - ale klidně nam můžeš dát napevno vyšší udma. nepoužívají cd/dvd obvykle udma-2?

ccleaner bych docela podezříval, že někde něco zoptimalizoval, a toto je výsledek.
co s tím - vlézt do registrů, najít postižený dvd v registrech:

HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Enum\IDE\třeba_CdRomTSSTcorp\šílený_řetězec
"LowerFilters"="imapi"
"UpperFilters"="redbook"