běžně se používá winupdate.
nějakým mimořádným postupem - snad registrací office - se změní na msupdate, a s tím jsou potíže co popisuješ.
u starších windows dělám aktualizace až instalací celých servicepacků. dílčí hotfixy stahuju ručně jen u extrémně nebezpečných chyb. proto mám službu automatické updaty vypnutou.