V tvém případě bych šel do toho HDD. Nový, větší disk je zpravidla rychlejší, nasaď ho jako primární (systém/aplikace/častá data) a pocítíš i celkové zrychlení práce na PC. Mít data na HDD "instantně" přístupná je taky velmi pohodlné.
Na starém disku bych kupříkladu vytvořil partition zašifrovanou skvělým TrueCryptem (www.truecryp.org) a mountoval bych ji jen pokud budeš data na ní potřebovat. Tím se zaprvé zbavíš obavy že ti data smaže nějaký zákeřný virus, zadruhé data budou "safe" před nepovolanými osobami.