Rozdíl v tom je že na 32bit windows ten 64bit (X64) program nepustíš,napíše chybovou hlášku.
Na 64bit můžou jet x64 i x86, přímo dělaný na 64bit je x64 a bývá vhodnější použít.
Jinak rozdíl v obou verzích programu většinou nijak na funkci nepoznáš...