Stačí si to nastavit. Nezáleží na typu účtu. Jenom je to pro každý účet individuální. Takže, pokud máš nastaveno u POP3 seskupování zpráv do témat třeba podle odesilatele, v účtu IMAP to nemusí být pravda.
Menu Zobrazit -> Seksupovat zprávy do témat -> nastavit dle libosti.