jdu si to ověřit, ale možná že máš pravdu - že poslední "system" je nadbytečný:
copy C:\WINDOWS\repair\system c:\WINDOWS\SYSTEM32\CONFIG
pravděpodobně by podle té původní syntaxe hledal podadresář "...\config\system"edit: a měl jsem chybu v cílové cestě (opsal jsem ji z dotazu) - má tam být samozřejmě adresář system32