Zdroji je to jedno.
Když bude větrákem dolů, bude to nasávat prach z venku, jednou za čas to profoukneš (třeba hubou) a vybereš z venku vysavačem.
Když bude větrákem nahoru, pomůže ti to s odsáváním tepla, ale zase může víc hučet, pokud ho však přeřve grafika, tak to je jedno. Alespoň by to pomohlo grafice k odvodu tepla a celkové lepší výměně vzduchu v bedně. Prach to nasaje jen ten, kterej ti pronikne do bedny, pokud dáš na vstup filtry, budeš za vodou.

Pokud je bedna se zdrojem dole, je záměr, aby byl zdroj větrákem dolů a tím nasával chladný vnější vzduch. Jinak by to nemělo žádnej přínos, krom vzhledu.