A jakou máš teda myš? Drátovou, bezdrátovou? USB/PS2? Laser, optika?
Může to být také způsobeno nějakou nečistotou na snímači myši, stačí třeba vlas. Ale jestli jsi zkoušel jinou myš a dělá to stále, tak to asi nebude tím.
Není v blízkém okolí nějaké elektromagnetické rušení? Třeba mobilní telefon, nestíněné reproduktory, ...?