skype možná běží jako služba (service). nevím, mi toto do pc nesmí.
rozdělení a nová instalace systému je na dýl. potřebuješ zjistit aktuální seznam hw, stáhnout všechny ovladače. po záloze, smazání celého disku a novém rozdělení budeš potřebovat znovu instalovat systém, poslední servicepack, nakonec všechny aplikace - a ještě je znovu nastavit a obnovit hesla.