porovnej si sám co ti víc vyhovuje. podobný výpis jako hijackthis má i combofix. autoruns nepoužívám, takže nemůžu konkrétně srovnat. obecně:
toho co se v pc spouští po startu je mnohem víc, než tyto logy obsahují. kvůli přehlednosti + pravděpodobnosti výskytu malware a hlavně kvůli ochraně systému před klikajícím uživatelem neukazují spouštěné drivery, vynechávají běžící služby microsoftu. (například známý "sms výpalný vir" by se takto před výpisem schoval).

mě v těch výpisech chybí obsah naplánovaných úloh (combofix tuším zobrazuje), a taky by mohly vypisovat stav funkce autorun.