záleží, po pročtené (pme) diskuzi, jak je to rozdělené.

dá se rozdělit binárně http://pc.poradna.net/q/view/161848-spojeni-vice-v ob-avi-mpeg-souboru prostě si soubor představ jako proužek a nůžkama ho rozstříháš- bez spojení nebudou další části fungovat, každý soubor obsahuje hlavičku, co je zač. u tohoto rozdělení hlavička bude jen u prvního souboru.

dále může být soubor rozdělen na více avi kontejnerů. každý soubor obsahuje hlavičku- to se spojuje ve videoeditoru.

zastaralý avi kontejner se vyznačuje seznamem snímků, zvaný index- ten je na konci souboru, může být poškozen.

takže řešení bych viděl ve zjištění, jak to teda je:
stáhni si disk investigator http://www.theabsolute.net/sware/dskinv.html a zkontroluj si, jestli jsou obsaženy hlavičky v souborech, pokud ne, spojuješ binárně, index poškozen, projedeš v avidemuxu.
jestli jsou hlavičky všude, avidemux, připojit soubory- uložit.

hlavičku avi poznáš jednoduše- řve na tebe, že je riff