COM A je sériový port, tam to rozhodně nepojede.
Co je to za čtečku karet a co máš za motherboard?
Čtečky se zapojují do USB, pokud jsou to čtečky interní, tak obvykle přímo do desky (na piny USB), někdy USB kabelem s klasickým konektorem zezadu do venkovních konektorů.
Ty tvoje konektory se mi nějak nezdají, na zapojení by mělo stačit 8 pinů. Nemáš k té čtečce manuál?