to vypadá na dobrou práci.

u direct show playerů\ editorů se to provádí takto:
player načte hlavičku- zavolá se příslušný splitter, který rozdělí jednotlivý proudy (audio, video, titulky apod.) v kontejneru a aktivuje na proudy příslušný přehrávací filtry. poté se v editoru udělá co potřebuješ a výstup se uloží pomocí kodéru do požadovaného výstupu.

audacity není direct show, ale princip je stejný. došel jsi až tam, že ti hapruje výstup.
ten problém nehledej v audacity, ale v kodéru. musí podporovat 5.1 proud a musí ho umět. z modrý rajdy to určitě bylo jako dts http://cs.wikipedia.org/wiki/Digital_Theater_Syste m , což třeba lame do mp3 nemusí umět (avidemux na mě pravidelně ječí, že tolik kanálů zvládne leda hovnocuc )

audacity podporuje i převodníky třetích stran a ffmpeg. ty budeš muset vymyslet do kterého formátu (který umí 6 kanálů) a kterým kodérem, který umí, to převést. tohle je ten zakopanej pes.

a asik dnes neodpovím, bo poradna je tuze zabržděná. přes tracert je tam vidět server, který má latenci šílenou.