Teoreticky to jde. Stejně jako u JPEGu by měl být možný bezztrátový ořez po 8mi bodech (umí to třeba JPEGCrops nebo XnView). Ale neznám ani jeden program, který by tohle uměl u MPEGu. Takže prakticky to možné není, pokud vím.
Navíc tím ořezem by se změnilo rozlišení a už by video neodpovídalo DVD-Video standardu, což je jediný rozumný důvod, proč ještě dnes používat MPEG-2.
Proto já vždy doporučuju zachytávat do bezztrátových kompresí, případně kompresí s vysokou kvalitou (MJPEG, DV). Potom si s tím můžu pohrát a vylepšit nějak to video.