Podívej se, jestli program, který používáš na přípravu flash, neumožňuje nastavit, jak se má emulovat flash při bootu: jestli jako A:, nebo C: (popř.vyšší). Mám tu zkušenost (s programem FlashBoot), že když se nastavilo A:, tak nešlo instalovat Windows (ale šel instalovat např. GAG Manager), kdežto při nastavení C: šly instalovat Windows, ale nešel instalovat GAG Manager (chtěl se nainstalovat na flash).