1. pokud ti padá datové spojení, tak buď máš opravdu mizerné spojení (anebo nějakým způsobem od ISP degradované) - ale to by se projevovalo i na ostatních FTP serverech, nebo je chyba u poskytovatele FTP serveru
2. jako další možnost mě napadá, že při přenosu větších souborů (celkem pomalou rychlostí 128kbps) může dojít k uzavření řídícího spojení na timeout. V takovém případě zkus v TC zaškrtnout volbu "Udržovat spojení opakovaným vysíláním příkazu" a nech nastaveno NOOP a opakování nastav např. na 30s. Bylo by BTW zajímavé, změřit čas, po kterém dojde k odpojení uživatele po poslední akci.
3. Web2ftp (už z názvu) nejspíše používá nějaký webový interface a ty se spojuješ na webovou stránku a teprve její backend vystavuje ftp spojení. Tudíž se v tomto případě používají z tvého pohledu nejen jiné porty, ale i jiný protokol.