Pokud je to přídavný ventilátor, je možné, že má nevhodě umístěné čidlo. Zkus to čidlo najít a dát někam jinam. Nejlépe tam, kde nebude úplně nejvyšší teplota ve skříni a zároveň na ně nebude foukat samotný ventilátor.
Jinak si myslím, že by ten ventilátor měl zvyšovat otáčky postupně, v závislosti na teplotě a ne rovnou na plný výkon, jako při sepnutí relé.
Pokud nepomůže přemístění čidla (nebo nenajdeš ovládání v BIOSu) tak mu můžeš snížit otáčky "natvrdo", předřadným odporem nebo diodou. Návod snadno najdeš na netu.