OS to neovlivní. Indexování disku je, pokud já vím, zužitkováno při rychlejším vyhledávání, ovšem na úkor "nepochopitelného" hrkání disku v dobách nečinnosti.
Osobně bych indexování disku vypnul a pro rychlejší/kvalitnější vyhledávání použil např. copernic desktop search (http://www.copernic.com/) nebo google desktop search (http://desktop.google.com/) případně jiný produkt.