Je to bug zobrazovania v IE spôsobený float: left.

Skús nahradiť štýly v časti "Kategorie s odkazy" za niečo takéto:

/* Kategorie s odkazy 
------------------------------------------------- */
.prvni, .druhy, .treti { padding: 30px 20px 0 30px; float:left; }
.prvni { padding-left: 50px; }
.obal ul { list-style-image: url(../sipka.png); }

BTW: Nemusíš každému elementu li nastavovať atribút class. Stačí to nastavíť len pre ul a v CSS sa na li odkazovať nejako takto: ul.trieda li.