Odpovím si sám. Snad to někomu pomůže.

Na IIS FTP, záložka účty Zabezpečení povolit anonymní připojení, povolit pouze anonymní přihlášení není zaškrtnuto. Na záložce Domovský adresář povolit zápis.

U adresáře, který je pro FTP domovský (ftproot) přidat právo pro Everyone a Měnit. Guest nestačí.

přes web rozhraní v Profile Manager zadat něco takového:
Profile Name: FTP-server
Protocol: FTP
Target URL: ftp://server.neco.cz
Port: 21
User Name: anonymous
Password: test@test.cz
File Name: scan#n

Uživatel tam po skenu dostane na ftp://server.neco.cz výsledek, který si přetáhne k sobě a smaže ho na FTP.