Hádám, ze máš na disku Windows XP a systém souborů NTFS.
V takovém případě je ti spouštěcí disketa k ničemu. Navíc spouštěcí disketa program Format standardně neobsahuje, musel bys jej tam nahrát nebo si vytvořit spouštěcí disketu na Windows 98.

Čistá instalace Windows XP se dělá tak, že naootuješ z instalačního CD, dojdeš k místu, kde se tě instalátor ptá, kam instalovat a zda máš možnost odstranit oddíl.
Tak to provedeš, vytvoříš nový a pokračuješ v instalaci.