netroufám si odhadnout, pod jakým písmenem jsou teď xp nainstalované, tipuju na d:
1. pro jistotu si zkopíruj z kořene oddílu s win98 soubory: boot.ini, ntldr, ntdetect.com do kořene xp (jsou skryté, a pozor na dementní schovávání přípon v xp)
2. jdou vymazat všechny podadresáře na nefunkčním 1.oddílu s win98. pro větší přehlednost jdou vybílit i všechny soubory z kořene toho oddílu, kromě uvedených v 1)
3. a je to

taky by šlo:
provést kopii souborů viz 1)
2a) po ní nabootovat s nějakým fdiskem/partition managerem a označit jako active=bootovací druhý oddíl s xp
3a) restart - a po úspěšném naběhnutí xp nechat první oddíl s w98 rychle zformátovat

edit:
pokud se xp označují jako oddíl s c:, šlo by to ještě jinak. kopírovat ty soubory viz 1), zeditovat boot.ini že system je na ...rdisk(0)partition(1) nebo přidat takový řádek, nějakým partition managerem zrušit 1.oddíl, druhý s xp přesunout na začátek, udělat si nové rozložení místa pro čistý systém [windows + program files] a nový oddíl pro ostatní data. ale to nejpracnější = nejdelší, a pokud se něco zasekne, přijdeš o všechno.