v tom případě stačí udělat "tříprůchodový" postup, kdy nejprve dva odstavce nahradíš třeba znakem # a pak provedeš klasické odebrání odstavců a následně nahradíš znak # zase zpátky odstavcem. Když se to dělá jednou za čas na jednom souboru, nemyslím, že je nutné na to používat nějaký program nebo si psát skript (který koneckonců dělá tutéž činnost, jen to udělá rychleji)