Virtualni PC je jen soubor na disku. Když odstraňuješ virtuální stroj, tak se tě program ptá, zda smazat i soubory. Ale kdykoliv to muzes smazat ručně
S diskem ti virtuální počítače ani program nijak manipulovat nebudou.
Pro VirtualBox je většina hlavnich linuxovych distribucí uz pripravena jako virtualni stroje, ale doporucuji si to nainstalovat od začátku, naučíš se to.