A už vidím problém.
Vaše certifikáty musí být v "Osobní" ne "Ostatní uživatelé"
Takže z ostatní uživatelé smazat
Kliknout na Osobní (první položka), pravá myš a import certifikátu
Naimportovat PFX

V Ostatní uživatelé je pouze veřejná část certifikátu, tzn. jde pomocí nich ověřovat, ale nejde podepisovat. proto se ani neukazují v ISignum