Jako jde na straně webového serveru pomocí skriptů komunikovat s e-mailovou síťovou službou, pak by to zajisté to samé uměl s ftp síťovou službou.
Vzdálený ftp prostředek lze připojit do místní adresářové struktury, viz fuse linuxový modul "curlftpfs", obdobně ssh...

Pokud je "dobrý" utf8, pak musí mít tuto znakovou sadu defaultně nastavenu i všichni klienti, což zjevně nemají.

A nenašel by se nějaký známý z univerzity?