No a o tom to je. Mrknul jsem na ten ReJig a ten zas neumí authoring z prostého mpegu. Začarovaný kruh. Já při použití TMPGEnc (bohužel není free, ale můžeš ho zkusit, třeba shledáš, že za něj těch 80 dolarů dáš) mohu v rámci authoringu rovnou provést i střih, takže je to sfouknuto ve dvou krocích vše.
K té citaci: není to jen o tom, že zařízení nahrává celý transport stream (to nemusí být nutně pravda - jde-li ale o diskusi k tvému přístroji, bude to tak - lze vyčíst z velikosti souboru), ale také o nápravě chyb, které se ve streamu chtě nechtě objeví. Rovnou ti mohu říct, že demux v ReJigu je víceméně opravdu jen o oddělení stop. Naproti tomu ProjectX vady i napraví. Že to nemusí být vždy k užitku je jasné, pokud ale nemáš záznam nakopnutý tak jako já ten testovací, nebudeš pozorovat rozdíl. Prohlédni si přiložené výpisy, stojí to za pozornost.
Přišel jsem ještě na jednu zajímavost. Po separaci ReJigem mě ImagoMPEG-Muxer poslal někam s audiostopou. Po separaci ProjectXem neměl žádných námitek. Tím neříkám, že ReJig je vadný, zkrátka jen neprovádí při separaci zároveň i korekce, případně je provádí nedostatečně. A to lze při zpracování nahrávek z DVB-T považovat za nedostatek.

před akcí (hodně nakopnutý soubor)
separace i authoring ReJigem
separace ProjectXem, authoring ReJigem

Pokud lpíš na Womble, měl bys před jeho použitím použít ProjectX v kombinaci s ImagoMPEG-Muxerem. Protože však ReJig při authoringu vyžaduje stopy separované, bude těch kroků už poněkud mnoho.
Proto by bylo lepší se buď naučit střih v ProjectX (ideální - pak by okamžitě následoval authoring v ReJig), nebo použít authoringový program, který zvládá i střih (TMPGEnc, určitě i jiné), nebo po Womble použít authoringový program, který umí zpracovat neseparovaný mpeg (aspoň o krok méně).

edit: Možností je dozajista ještě mnohem více, ale jedna konstanta tu je - ProjectX bys měl použít každopádně! Můj názor.